依据我国相关法律的规定，建筑工程司法鉴定收费标准般是按一定比例收取的，例如鉴定标的价值超过1000万的，按0.1%收取。
《司法鉴定收费管理形式》
第八条 涉及财产案件的司法鉴定收费，根据诉讼标的和鉴定标的两者中的较小值，按照标的额比例分段累计收取。具体比例如下：
(一)不超过10万元的，按照本形式附件中所列收费标准执行;
(二)超过10万元至50万元的部分，按照1%收取;
(三)超过50万元至100万元的部分，按照0.8%收取;
(四)超过100万元至200万元的部分，按照0.6%收取;
(五)超过200万元至500万元的部分，按照0.4%收取;
(六)超过500万元至1000万元的部分，按照0.2%收取;
(七)超过1000万元的部分，按照0.1%收取。
对于标的额较大的，可由省级价格主管部门会同同级司法
行政部门根据当地实际情况制定司法鉴定收费金额上限。
本条第一款所称涉及财产案件的司法鉴定收费，只适用于司法鉴定中物证类的文书鉴定和痕迹鉴定中的手印鉴定，不适用于其他鉴定。