法律分析：根据法律规定，当发生证券基金纠纷时，需要通过调解解决纠纷。调解费用是由当事人自行承担的，调解费用包括调解委员会的组织和调解员的酬金等费用。如果当事人协商一致，在纠纷处理过程中可以约定由哪一方承担调解费用。
法律依据：
1.《证券法》第百零三条规定：证券纠纷可通过仲裁、诉讼、调解等方式解决。
2.《中华人民共和国证券投资基金法》第五十五条规定：基金份额持有人之间的纠纷应当依据基金合同的约定解决。基金合同未作约定或约定不明确的，应当依据有关法律规定处理。
3.《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零六条规定：当事人达成调解协议，应当自行承担调解费用。
综上，证券基金纠纷的调解费用由当事人自行承担，如果当事人协商一致，也可以在纠纷处理过程中约定由哪一方承担调解费用。
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